O Departamento de 2ºCiclo tem como missão ou objectivo estabelecer um maior elo de ligação entre os alunos de 2º ciclo, de Pos-Graduações, Mestrados e Doutoramento com a Associação de Estudantes com o ISEG, no sentido de servir todas as suas necessidades.

Assim, o Departamento é responsável pela organização de eventos como o Dia de Mestrado e Feira de Emprego, e pelo apoio aos alunos do ponto de vista pedagógico e de integração.

Este departamento é constituído pela coordenadora Diana Sousa e restantes membros: Sara Dias, Hugo Silva e Miguel Mozos.